Um zu verhindern, daß er den unkontrollierbaren Akira aus seinem Tiefschlaf weckt, haben die übrigen Kindgreise beschlossen, Tetsuo durch das Medium Kei zu töten. Doch Tetsuo kann entkommen, und es gelingt ihm, in den Bunker, der Akiras Kältekammer beherbergt, einzudringen. Aber Kaneda und Kei können das entstandene Chaos nutzen, um ebenfalls in den Bunker zu gelangen...
Kaneda und Kei gelint es, den wiedererweckten Akira Tetsuos Einfluß zu entreißen. Noch ahnt Akira nicht, welche Kräfte in ihm schlummern. Der »Colonel« startet eine gigantische Militäraktion, um ihn zu vernichten, bevor er sich seiner Macht bewußt wird. Kei beschließt, Akira bei Nezu, dem politischen Führer der Untergrundbewegung, zu verstecken. Doch Nezu verfolgt mittlerweile eigene Pläne, für deren Duchsetzung er Akiras Kräfte nutzen will.
Dies ahnt Miyako, die religiöse Führerin der Kindgreise. Sie beauftragt die junge Kämpferin Sakaki, Akira zu entführen...
Der »Colonel« nutzt den Ausnahmezustand, der über Tokio verhängt wurde, um militärisch gegen Nezus Untergrundorganisation vorzugehen. Im allgemeinen Durcheinander des Kampfes zwischen Nezus Männern und den Soldaten des »Colonels« kann die Kämpferin Sakaki mit Akira fliehen. Kaneda und Kei gelingt es, einen Panzer in ihre Gewalt zu bringen und damit zu flüchten...