Achtunddreißig Jahre nach der völligen Zerstörung Tokios durch eine neuartige Superbombe hat man die Metropole am Rand ihres ehemaligen Gebiets neu aufgebaut. Der innere Sektor, die »alte Stadt«, ist für die Bevölkerung gesperrt. Aber Kaneda und seine Motorradgang kümmern sich nicht um Verbote. Bei einem ihrer nächtlichen Wettrennen in der menschenleeren Zone haben sie eine unheimliche Begegnung mit einem greisenhaften Kind. Nach diesem Zusammentreffen scheint Kanedas Freund Tetsuo plötzlich ungeahnte Kräfte zu besitzen. Er flieht aus einem geheimen Labor, in dem der mysteriöse Leiter des »Akira«-Projekts, der »Colonel«, medizinische Tests an ihm durchführen ließ, und wird Anführer einer Motorradgang, der »Clowns«. Die Gang- Mitglieder müssen ihm Drogen beschaffen, mit denen er seine heftigen Kopfschmerzen bekämpfen kann, die als Folge seiner neuen unheimlichen Kräfte auftreten. Er ahnt nicht, daß eine Untergrundorganisation die Kapsel in ihren Besitz bringen will...
Kaneda und seine Anhänger beschließen, die »Clowns« in eine Falle zu locken. Es kommt zu einem blutigen Kampf zwischen den beiden Gangs. Im Getümmel gelangtTetsuo in den Besitz der von Kaneda entwendeten Kapsel und schluckt sie, um seine extremen Kopfschmerzen zu bekämpfen, doch die Dosis ist tödlich. Da geschieht das Unfaßbare: Tetsuo erwacht wieder zum Leben. Machen ihn seine Kräfte unsterblich? Ist er die Nummer 41?
Nach einem blutigen Kampf werden Kaneda und Kei zusammen mit dem schwer verletzten Tetsuo in die Zentrale des »Colonels« geflogen. Dort erholt sich Tetsuo schnell von seinen Verletzungen. Er will jetzt mit Akira in Kontakt treten, der seit über dreißig Jahren in künstlichem Kälteschlaf gehalten wird. Die anderen Kindgreise befürchten jedoch, daß eine entsetzliche Katastrophe heraufbeschworen werden könnte, wenn Akira geweckt wird...