Vor 16 Jahren wurde Eka Tokura, die Tochter des Präsidenten von Tokura Electronics, entführt. Hinter der Entführung stand die Anti-Cyborg-Bewegung „Kokoku-Brigade“. Jetzt wird Eka auf Fotos der Spezialeinheit SST entdeckt – und
wie es scheint, steht sie auf der Seite der Terroristen! Besonders mysteriös: Eka scheint in den letzten 16 Jahren kein bisschen gealtert zu sein … Motoko und ihr Team brauchen mehr Informationen und infiltrieren das HQ der Brigade, eine künstliche Insel im Meer …